mmCIF

什么是 mmCIF？

mmCIF（macromolecular Crystallographic Information File）是一种基于文本的自描述数据格式，专为宏观分子结构数据设计。它由国际晶体学联合会（IUCr）在 1990 年代初期开发的 CIF（Crystallographic Information File）格式扩展而来。

核心特点一览

特性	传统 PDB	PDBx/mmCIF
格式类型	固定列宽（80 列/行）	自描述键值对 + 表格
原子数上限	99,999	无限制
链数上限	62	无限制
可扩展性	已冻结	持续演进
数据关系	隐式、靠位置推断	显式、带元数据约束
字符编码	ASCII	ASCII
特殊字符占位	空格填充	`?`（缺失）/ `.`（不适用）

名称辨析

CIF：小分子晶体学信息文件（core CIF）
mmCIF：扩展到宏观分子（蛋白质、核酸）的 CIF 字典
PDBx：PDB 交换格式，mmCIF 字典的 PDB 适配层
PDBx/mmCIF：wwPDB 使用的完整格式名称，当前版本为 V5

文件结构：四大核心概念

mmCIF 文件建立在 STAR（Self-defining Text Archive and Retrieval）语法之上，整个文件由以下四个层次构成：

数据块（Data Block）
├── 数据项（Data Item）— 键值对
├── 数据表格（Loop_）— 多行数据
└── 保存帧（Save Frame）— 仅用于字典定义

数据块（Data Block）

每个 mmCIF 文件由一个或多个 数据块 组成，以 data_ 开头：

cif

data_4HHB

data_ 后面的文本是数据块标识符（通常为 PDB ID）
一个数据块描述一个结构条目
数据块在遇到下一个 data_ 或文件结束时终止
一个文件可包含多个数据块（多结构）

数据项（Data Item）

所有数据项以 下划线 _ 开头，格式为 _类别名.属性名：

cif

_cell.length_a    63.150
_cell.length_b    83.590
_cell.angle_alpha 90.00
_citation.year    1984
_entry.id         4HHB

类别名（category）：如 cell、citation、entry
属性名（attribute）：如 length_a、year、id
组合 _category.attribute 称为 mmCIF token
类别名和属性名 不区分大小写

键值对 vs 表格

mmCIF 提供两种数据呈现方式：

键值对风格（Key-Value）：每个数据项后紧跟一个值

cif

_cell.entry_id   4HHB
_cell.length_a   63.150
_cell.length_b   83.590
_cell.length_c   53.800
_cell.angle_alpha 90.00
_cell.angle_beta  99.34
_cell.angle_gamma 90.00
_cell.Z_PDB       4

表格风格（Tabular / Loop）：使用 loop_ 指令定义多行数据表

cif

loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
ATOM 1 N  N  VAL A 1 6.204  16.869 4.854 1.00 49.05
ATOM 2 C  CA VAL A 1 6.913  17.759 4.607 1.00 43.14
ATOM 3 C  C  VAL A 1 8.504  17.378 4.797 1.00 24.80
ATOM 4 O  O  VAL A 1 8.805  17.011 5.943 1.00 37.68

loop_ 后面的数据项名对应表格的列，后续每行数据对应一条记录。

注释与特殊字符

符号	用途	示例
`#`	注释行 / 分类分隔符	`# cell parameters`
`?`	值缺失（unknown）	`_entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue ?`
`.`	值不适用（not applicable）	`_struct_ref.biol_id .`
`'...'`	单引号包裹含空格的字符串	`'Fermi, G.'`
`"..."`	双引号包裹含空格的字符串	`"Pantoate-activating enzyme"`
`;...;`	分号包裹多行文本	见下方示例

多行文本用首尾分号（必须位于行首）包裹：

cif

_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
;VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSH
GSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKL
LSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
;

数据类型系统

mmCIF 字典定义了丰富的数据类型，确保数据的规范性和机器可验证性：

类型代码	原始类型	说明	示例
`code`	char	单字代码（区分大小写）	`primary`
`ucode`	uchar	单字代码（不区分大小写）	`HEM`
`int`	numb	整数	`-42`、`2024`
`float`	numb	浮点数	`63.150`、`1.5e-3`
`line`	char	单行文本	`X-PLOR 3.1`
`text`	char	多行文本	序列、备注
`name`	uchar	mmCIF 名称格式	`_atom_site.id`
`idname`	uchar	标识符名称	`citation_author`
`any`	char	任意值	通配类型
`yyyy-mm-dd`	char	标准日期格式	`2024-06-15`
`uchar3`	uchar	3 字符代码	`HEM`
`symop`	char	对称操作	`1_555`、`4_657`

核心数据类别详解

一个完整的 mmCIF 文件包含数十个数据类别（category），下面按功能分组介绍最重要的部分。

文件头与审计信息

cif

data_4HHB

_audit_conform.dict_name    mmcif_pdbx.dic
_audit_conform.dict_version 5.367
_audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic

_entry.id 4HHB

数据项	含义
`_audit_conform.dict_name`	使用的字典名称
`_audit_conform.dict_version`	字典版本号
`_entry.id`	结构条目标识符

实验信息（EXPTL）

cif

loop_
_exptl.entry_id
_exptl.method
_exptl.crystals_number
4HHB X-RAY DIFFRACTION ?

常见实验方法值：X-RAY DIFFRACTION、SOLUTION NMR、ELECTRON MICROSCOPY、NEUTRON DIFFRACTION、SOLUTION SCATTERING。

晶体学参数（CELL & SYMMETRY）

cif

_cell.entry_id    4HHB
_cell.length_a    63.150
_cell.length_b    83.590
_cell.length_c    53.800
_cell.angle_alpha 90.00
_cell.angle_beta  99.34
_cell.angle_gamma 90.00
_cell.Z_PDB       4

_symmetry.space_group_name_H-M   'C 1 2 1'
_symmetry.Int_Tables_number      5

数据项	含义
`_cell.length_a/b/c`	晶胞边长（Å）
`_cell.angle_alpha/beta/gamma`	晶胞夹角（°）
`_cell.Z_PDB`	不对称单元中的分子数
`_symmetry.space_group_name_H-M`	空间群（Hermann-Mauguin 符号）
`_symmetry.Int_Tables_number`	国际表编号

实体定义（ENTITY）

实体（Entity） 是 mmCIF 中一个极其重要的概念——它代表结构中 化学上独立 的分子种类。同一实体的多个拷贝（如血红蛋白的两条 α 链）只定义一个实体。

cif

loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
1 polymer     man 'HEMOGLOBIN (DEOXY) (ALPHA CHAIN)' 15150.353 2
2 polymer     man 'HEMOGLOBIN (DEOXY) (BETA CHAIN)'  15890.198 2
3 non-polymer syn 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE'   616.487 4
4 non-polymer syn 'PHOSPHATE ION'                       94.971 2
5 water       nat water                                  18.015 221

实体类型包括：polymer（聚合物）、non-polymer（非聚合物/配体）、water（水）。

聚合物序列（ENTITY_POLY & ENTITY_POLY_SEQ）

cif

_entity_poly.entity_id        1
_entity_poly.type             'polypeptide(L)'
_entity_poly.nstd_linkage     no
_entity_poly.nstd_monomer     no

loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 ALA n
1 2 MET n
1 3 ALA n
1 4 ILE n
1 5 PRO n
# ... 省略后续残基

化学组分字典（CHEM_COMP）

每个氨基酸、核苷酸、配体都有详细的化学定义：

cif

_chem_comp.id          HEM
_chem_comp.name        "PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE"
_chem_comp.type        NON-POLYMER
_chem_comp.formula     "C34 H32 Fe N4 O4"
_chem_comp.formula_weight 616.487
_chem_comp.three_letter_code HEM
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0

原子坐标（ATOM_SITE）—— 文件的核心

_atom_site 类别通常是 mmCIF 文件中最大的部分，存储每个原子的完整信息：

cif

loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N  N . VAL A 1 1 ? 6.204  16.869 4.854 1.00 49.05 ? 1 VAL A N 1
ATOM 2 C  CA . VAL A 1 1 ? 6.913  17.759 4.607 1.00 43.14 ? 1 VAL A CA 1
ATOM 3 C  C  . VAL A 1 1 ? 8.504  17.378 4.797 1.00 24.80 ? 1 VAL A C 1

关键字段对照表（mmCIF ↔ PDB 概念）：

mmCIF 字段	PDB 对应	含义
`_atom_site.group_PDB`	ATOM/HETATM	记录类型
`_atom_site.id`	serial	原子编号
`_atom_site.type_symbol`	element	元素符号
`_atom_site.label_atom_id`	atom name	原子名
`_atom_site.label_comp_id`	resName	残基名（3字母）
`_atom_site.label_asym_id`	chainID	链/不对称单元 ID
`_atom_site.label_seq_id`	resSeq	残基序号
`_atom_site.Cartn_x/y/z`	x/y/z	笛卡尔坐标（Å）
`_atom_site.occupancy`	occupancy	占有率
`_atom_site.B_iso_or_equiv`	B-factor	各向同性温度因子
`_atom_site.pdbx_PDB_model_num`	model	模型编号

`label_` vs `auth_` 的区别

这是 mmCIF 新手最容易困惑的地方：

前缀	含义	示例
`label_*`	wwPDB 规范化后的标识	`label_asym_id A`
`auth_*`	作者提交时的原始标识	`auth_asym_id H`

例如，数据库内部将链标记为 A，但作者原始链名可能是 H。两套标识并存，确保数据溯源完整性。

各向异性温度因子（ATOM_SITE_ANISOTROP）

对于需要各向异性 B 因子精修的原子：

cif

loop_
_atom_site_anisotrop.id
_atom_site_anisotrop.U[1][1]
_atom_site_anisotrop.U[1][2]
_atom_site_anisotrop.U[1][3]
_atom_site_anisotrop.U[2][2]
_atom_site_anisotrop.U[2][3]
_atom_site_anisotrop.U[3][3]
1 0.0123 0.0015 0.0008 0.0156 0.0021 0.0189

二级结构（STRUCT_CONF & STRUCT_SHEET_RANGE）

cif

loop_
_struct_conf.id
_struct_conf.conf_type_id
_struct_conf.beg_label_asym_id
_struct_conf.beg_label_seq_id
_struct_conf.end_label_asym_id
_struct_conf.end_label_seq_id
HELX_P1 HELX_R_A  A 5   A 18
HELX_P2 HELX_R_B  A 20  A 35

结构连接（STRUCT_CONN）

描述链间/链内二硫键、盐桥、氢键等：

cif

loop_
_struct_conn.id
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
disu1 disulf A CYS 104  SG  A CYS 117  SG  2.05

精修统计（REFINE）

cif

_refine.entry_id             4HHB
_refine.ls_d_res_high        1.74
_refine.ls_d_res_low         10.00
_refine.ls_R_factor_R_work   0.171
_refine.ls_R_factor_R_free   0.211
_refine.B_iso_mean           18.5
_refine.pdbx_ls_cross_valid_method 'THROUGHOUT'

引用文献（CITATION & CITATION_AUTHOR）

cif

loop_
_citation.id
_citation.title
_citation.journal_abbrev
_citation.journal_volume
_citation.page_first
_citation.page_last
_citation.year
_citation.journal_id_ISSN
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'Structure of haemoglobin' 'J. Mol. Biol.' 155 395 408 1982 ? 12345678 10.1016/...

loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Fermi, G.'     1
primary 'Perutz, M.F.'  2

PDB → mmCIF 数据项映射

下表列出常见 PDB 记录到 mmCIF 数据项的对应关系：

PDB 记录	mmCIF 数据项
`HEADER` 分类	`_struct_keywords.pdbx_keywords`
`HEADER` PDB ID	`_entry.id`
`TITLE`	`_struct.title`
`EXPDTA`	`_exptl.method`
`AUTHOR`	`_audit_author.name`
`KEYWDS`	`_struct_keywords.text`
`CRYST1`	`_cell.` + `_symmetry.`
`ATOM/HETATM`	`_atom_site.*`
`ANISOU`	`_atom_site_anisotrop.*`
`HELIX`	`_struct_conf`（类型为 HELX）
`SHEET`	`_struct_sheet_range`
`SSBOND`	`_struct_conn`（类型为 disulf）
`LINK`	`_struct_conn`（类型为 covale）
`SEQRES`	`_entity_poly_seq.*`
`MODRES`	`_pdbx_struct_mod_residue.*`
`HETNAM`	`_chem_comp.name`
`FORMUL`	`_chem_comp.formula`
`REMARK 3` (R值等)	`_refine.*`
`REMARK 200` (衍射数据)	`_diffrn.` + `_reflns.`
`REMARK 280` (结晶条件)	`_exptl_crystal_grow.*`
`REVDAT`	`_database_PDB_rev.*`
`JRNL`	`_citation.` + `_citation_author.`
`CONECT`	（mmCIF 中通常不需要，由坐标推导）

PDB ID 的演进：从 4 字符到 12 字符

由于 4 字符 PDB ID（如 1ABC）的空间即将耗尽，wwPDB 引入了扩展 ID 格式：

过渡期格式：pdb_00009o0b（前缀 pdb_ + 8 位字母数字），同时保留 4 字符 ID
最终格式：pdb_10001b5f（纯 12 字符，不再有 4 字符对应）
切换时间：2027 年 7 月 21 日起，wwPDB 将只发放扩展 ID
格式影响：仅分配扩展 ID 的结构 只以 mmCIF 和 PDBML（XML）格式分发，不再有 PDB 格式

mmCIF 文件中的 ID 表示：

cif

loop_
_database_2.database_id
_database_2.database_code
_database_2.pdbx_database_accession
_database_2.pdbx_DOI
PDB    pdb_00009o0b  10.2210/pdb9o0b/pdb  WWPDB D_1000294107

字典与元数据系统（DDL2）

mmCIF 的强大之处在于它的 自描述性——所有数据项的行为由字典（Dictionary）定义。字典使用 DDL2（Dictionary Definition Language 2）编写。

字典的核心功能

数据类型约束：每个数据项声明其类型（int、float、code 等）
取值范围：可定义最小值/最大值
受控词表：枚举类型的值必须从中选择
父子关系：定义跨类别的数据引用（类似外键）
必填/可选：标记数据项是否必须出现

保存帧（Save Frame）

字典中的定义用 save_ 帧封装：

cif

save_CITATION
_category.description
;Data items in the CITATION category record details about the literature
 cited relevant to the contents of the data block.
;
_category.id        citation
_category.mandatory_code no

save__citation.id
_item_description.description
;The value of _citation.id must uniquely identify a record in the CITATION list.
;
loop_
_item.name
_item.category_id
_item.mandatory_code
'_citation.id'          citation yes
'_citation_author.citation_id' citation_author yes
'_citation_editor.citation_id' citation_editor yes
'_software.citation_id'        software       yes
_item_type.code code
save_

注意：save_ 帧只出现在字典文件中，数据文件不使用。

完整 mmCIF 文件结构示例

下面是一个极度简化的 mmCIF 文件骨架，展示各部分的组织顺序：

cif

#==============================================================
data_4HHB
#==============================================================

# --- 审计与字典 conformance ---
_audit_conform.dict_name    mmcif_pdbx.dic
_audit_conform.dict_version 5.367
_entry.id                   4HHB

# --- 结构标题 ---
_struct.title 'THE STEREOCHEMISTRY OF HEMOGLOBIN'
_struct_keywords.pdbx_keywords 'OXYGEN TRANSPORT'
_struct_keywords.text         'HEMOGLOBIN, OXYGEN TRANSPORT'

# --- 实验方法 ---
loop_
_exptl.entry_id
_exptl.method
_exptl.crystals_number
4HHB X-RAY DIFFRACTION ?

# --- 晶胞参数 ---
_cell.entry_id    4HHB
_cell.length_a    63.150
_cell.length_b    83.590
_cell.length_c    53.800
_cell.angle_alpha 90.00
_cell.angle_beta  99.34
_cell.angle_gamma 90.00
_cell.Z_PDB       4

# --- 空间群 ---
_symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1'
_symmetry.Int_Tables_number     5

# --- 实体定义 ---
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
1 polymer man 'HEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN)' 15150.353
2 polymer man 'HEMOGLOBIN (BETA CHAIN)'  15890.198

# --- 化学组分 ---
_chem_comp.id      HEM
_chem_comp.name    "PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE"
_chem_comp.formula "C34 H32 Fe N4 O4"

# --- 作者 ---
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Fermi, G.'     1
'Perutz, M.F.'  2

# --- 原子坐标（最庞大的部分）---
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
ATOM 1 N  N VAL A 1 6.204  16.869 4.854 1.00 49.05
ATOM 2 C  CA VAL A 1 6.913  17.759 4.607 1.00 43.14
# ... 数千行原子记录 ...

# --- 精修信息 ---
_refine.ls_R_factor_R_work 0.171
_refine.ls_R_factor_R_free 0.211

常见陷阱与最佳实践

注意事项

不要假设字段顺序：mmCIF 是声明式的，字段顺序不固定，解析时应按名称查找
注意 ? 和 . 的区别：? 表示"缺失/未知"，. 表示"不适用/有意省略"，两者语义不同
引号规则：含空格的值必须加引号；多行值必须用分号包裹
label vs auth：分析链/残基编号时，确认你用的是哪套标识
loop_ 不可嵌套：mmCIF 只允许一层 loop，复杂关系用父子引用表达

文件大小优化建议

对于包含数十万原子的大结构（如核糖体、病毒衣壳），wwPDB 推荐：

将 _audit_syntax 信息放在文件靠前位置
使用固定宽度列格式（wwPDB 标准做法）
先定义被引用的数据（如 _entity 在 _entity_poly_seq 之前）
推荐数据排列顺序：chem_comp → chem_comp_bond → entity_poly_seq → atom_site → atom_site_anisotrop → struct_conn → struct_conf → struct_sheet_range

参考资源

官方文档：mmCIF Home
PDBx/mmCIF 字典（V5）：https://mmcif.wwpdb.org/dictionaries/mmcif_pdbx_v50.dic/Index
入门指南：Beginner's Guide to PDBx/mmCIF
用户指南：https://mmcif.pdb.org/docs/user-guide/guide.html
FAQ：https://mmcif.wwpdb.org/docs/faqs/pdbx-mmcif-faq-format.html
PDB ↔ mmCIF 映射表：https://mmcif.wwpdb.org/docs/pdb_to_pdbx_correspondences.html
Biopython 文档：https://biopython.org/docs/dev/Tutorial/chapter_pdb.html
Gemmi（高性能 CIF 解析库）：https://gemmi.readthedocs.io/
IUCr CIF 规范：https://it.iucr.org/

behavior 扩展

Maple

动画功能

编辑功能

mmCIF

什么是 mmCIF？

核心特点一览

名称辨析

文件结构：四大核心概念

数据块（Data Block）

数据项（Data Item）

键值对 vs 表格

注释与特殊字符

数据类型系统

核心数据类别详解

文件头与审计信息

实验信息（EXPTL）

晶体学参数（CELL & SYMMETRY）

实体定义（ENTITY）

聚合物序列（ENTITY_POLY & ENTITY_POLY_SEQ）

化学组分字典（CHEM_COMP）

原子坐标（ATOM_SITE）—— 文件的核心

`label_` vs `auth_` 的区别

各向异性温度因子（ATOM_SITE_ANISOTROP）

二级结构（STRUCT_CONF & STRUCT_SHEET_RANGE）

结构连接（STRUCT_CONN）

精修统计（REFINE）

引用文献（CITATION & CITATION_AUTHOR）

PDB → mmCIF 数据项映射

PDB ID 的演进：从 4 字符到 12 字符

字典与元数据系统（DDL2）

字典的核心功能

保存帧（Save Frame）

完整 mmCIF 文件结构示例

常见陷阱与最佳实践

注意事项

文件大小优化建议

参考资源

mmCIF ​

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名称辨析 ​

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数据块（Data Block） ​

数据项（Data Item） ​

键值对 vs 表格 ​

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数据类型系统 ​

核心数据类别详解 ​

文件头与审计信息 ​

实验信息（EXPTL） ​

晶体学参数（CELL & SYMMETRY） ​

实体定义（ENTITY） ​

聚合物序列（ENTITY_POLY & ENTITY_POLY_SEQ） ​

化学组分字典（CHEM_COMP） ​

原子坐标（ATOM_SITE）—— 文件的核心 ​

label_* vs auth_* 的区别 ​

各向异性温度因子（ATOM_SITE_ANISOTROP） ​

二级结构（STRUCT_CONF & STRUCT_SHEET_RANGE） ​

结构连接（STRUCT_CONN） ​

精修统计（REFINE） ​

引用文献（CITATION & CITATION_AUTHOR） ​

PDB → mmCIF 数据项映射 ​

PDB ID 的演进：从 4 字符到 12 字符 ​

字典与元数据系统（DDL2） ​

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注意事项 ​

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参考资源 ​

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数据块（Data Block）

数据项（Data Item）

键值对 vs 表格

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实验信息（EXPTL）

晶体学参数（CELL & SYMMETRY）

实体定义（ENTITY）

聚合物序列（ENTITY_POLY & ENTITY_POLY_SEQ）

化学组分字典（CHEM_COMP）

原子坐标（ATOM_SITE）—— 文件的核心

`label_` vs `auth_` 的区别

各向异性温度因子（ATOM_SITE_ANISOTROP）

二级结构（STRUCT_CONF & STRUCT_SHEET_RANGE）

结构连接（STRUCT_CONN）

精修统计（REFINE）

引用文献（CITATION & CITATION_AUTHOR）

PDB → mmCIF 数据项映射

PDB ID 的演进：从 4 字符到 12 字符

字典与元数据系统（DDL2）

字典的核心功能

保存帧（Save Frame）

完整 mmCIF 文件结构示例

常见陷阱与最佳实践

注意事项

文件大小优化建议

参考资源