十三、附录
Qbics-Molstar 分子可视化平台用户手册
官方网站:https://molstar.szbl.ac.cn/viewer
1. 支持文件格式列表
本平台支持多种分子结构相关文件格式,涵盖文件打开、轨迹加载、模型导出、动画导出、几何结构导出等全流程操作,不同功能模块对应适配格式如下,同时按文件类型进行分类整理,便于科研人员根据使用场景快速查阅。
1.1 按功能分类
| 功能模块 | 支持文件格式 |
|---|---|
| Open Files(打开文件) | .ccp4、.mrc、.map、.dsn6、.brix、.cub、.cube、.dx、.dxbin、.cif、.bcif、.psf、.prmtop、.parm7、.top、.dcd、.xtc、.trr、.nc、.nctraj、.dat、.mdcrd、.lammpstrj、.xyz、.pdb、.h5md、.ply、.mmcif、.mcif、.ent、.pdbqt、.gro、.gjf、.inp、.data、.mol、.sdf、.sd、.mol2、.mwfn、.wfn、.wfx、.molden、.fch、.png、.jpg、.jpeg、.rxh、.g3d、.mvsj、.mvsx、.rst7、.gz、.zip |
| Load Trajectory(加载轨迹) 模型文件 | .psf、.prmtop、.parm7、.top、.bcif、.cif、.mmcif、.mcif、.pdb、.ent、.pdbqt、.gro、.xyz、.gjf、.inp、.data、.lammpstrj、.mol、.sdf、.sd、.mol2、.mwfn、.wfn、.wfx、.molden、.fch、.png、.jpg、.jpeg、.rxh、.g3d |
| Load Trajectory(加载轨迹) 坐标文件 | .dcd、.xtc、.trr、.nc、.nctraj、.dat、.mdcrd、.lammpstrj、.xyz、.pdb、.h5md |
| Export Models(导出模型) | .bcif、.cif、.pdb、.mmcif、.pdbqt、.gro、.xyz、.mol、.mol2、.mwfn、.wfn、.wfx、.molden、.fch、.rxh、.cub、.can、.fract、.sm |
| Export Animation(导出动画) | .mp4、.avi、.gif、.mkv |
| Export Geometry(导出几何结构) | .glb、.stl、.obj、.usdz、.svg |
1.2 按文件类型分类
| 文件类型 | 类型属性 | 支持文件格式 |
|---|---|---|
| Volume Formats(体数据格式) | Binary(二进制) | .ccp4、.mrc、.map、.dsn6、.brix、.dxbin、.bcif |
| String(字符型) | .cub、.cube、.dat、.dx、.cif | |
| Topology Formats(拓扑格式) | String(字符型) | .psf、.prmtop、.parm7、.top |
| Coordinates Formats(坐标格式) | Binary(二进制) | .dcd、.xtc、.trr、.nc、.nctraj、.dat、.mdcrd、.h5md |
| String(字符型) | .lammpstrj、.xyz、.pdb、.rst7 | |
| Shape Formats(形状格式) | String(字符型) | .ply |
| Trajectory Formats(轨迹格式) | Binary(二进制) | .bcif、.png、.jpg、.jpeg、.h5md |
| String(字符型) | .cif、.mmcif、.mcif、.pdb、.ent、.pdbqt、.xyz、.gjf、.inp、.data、.lammpstrj、.gro、.mol、.mol2、.sd、.sdf、.mwfn、.wfn、.wfx、.molden、.fch、.rxh、.xyz |