2.可视化电子结构

通过 `.mwfn` 实现电子结构可视化

此处以 15-冠醚-5 闭壳层分子体系的单点能计算为例，通过 Qbics-MolStar 可视化其电子结构
通过访问与安装，可视化文件或 SMILES 代码的两种方法（拖拽 / 选择文件）使 .mwfn 文件在 Qbics-MolStar 界面显示渲染。
渲染结果如下：
可以观察到，界面左侧会弹出当前渲染体系的文件名：15-Crown-5.mwfn

渲染体系的分子轨道

渲染体系的分子轨道，鼠标移动至文件名所在位置，点击右键，选择 View Molecular Orbitals 以实现分子轨道渲染的准备工作。
点击 View Molecular Orbitals 选项后，会提示当前分子体系的轨道序号。轨道序号越大，轨道的能量越高。同时，occ 表示当前轨道的占据数。
- occ=0：表示未占据的虚轨道；
- occ=2：表示完全占据的轨道；
- occ=1：通常表示开壳层体系中的单占轨道；
如下图展示，我们发现，轨道序号 60 为最高占据轨道 HOMO，为最后一个 occ=2 的轨道。轨道序号 61 为最低非占据轨道，为第一个 occ=0 的轨道。
此处，我们点击轨道序号 60，以 HOMO 轨道为例进行轨道渲染。默认渲染结果如下：

调整分子轨道渲染样式

调整分子轨道渲染的透明度
- 点击右侧 Actions 按钮弹出渲染样式修改框，此处我们修改正相位轨道区域。
- 默认 type 为 Isosurface 选项，除此选项之外，还包括 Direct Volumn, Dot, Segment 以及 Slice。
- 在选中 Isosurface 的基础之上，点击右侧的 Type Properties 按钮以进一步获得样式修改选项。
- 在 Opacity 一栏内，通过拖拽进度条或直接键入数字的方式，自定义轨道展示透明度。
- 默认情况下 Opacity 的数值为 0.4。此处，我们将 Opacity 调整至 0.8，为您演示分子轨道样式的改变。
调整分子轨道渲染的颜色
- 在当前界面右下角，点击色块以获得 Select Color 选项，此处我们修改负相位轨道区域。
- 您可以有两种方式去调整分子轨道渲染的颜色
  - 直接选用 Select Color 下方默认的色块，如湖蓝色。
  - 在 RGB 选项中，可以手动输入数值来指定渲染颜色，如 RGB(199, 21, 133)。
调整分子轨道等值面的数值方式：
- 在 Iso Value Kind 部分存在两种调整等值面的选项：
  - absolute：使用绝对数值来定义等值面
  - relative：使用相对比例来定义等值面（默认）
- 若我们选取默认 relative 作为等值面定义的方式，其 Iso Value 数值默认为了 ±5。您可以通过拖拽进度条或直接键入数字的方式去修改 Iso Value 的数值。在这里，我们以正相位轨道区域为例，分别为您提供了默认数值（5）下的分子轨道渲染以及手动修改（0.45）的分子轨道渲染结果。
- 若我们选取 absolute 作为等值面定义的方式，您同样可以通过拖拽进度条或直接键入数字的方式去修改 Iso Value 的数值。在这里，我们同样以正相位轨道区域为例，分别为您提供了默认数值（0.042789）下的分子轨道渲染以及手动修改（0.0045）的分子轨道渲染结果。